全面负责中心行政、业务工作,分管中心办公室、党委办公室、工会、结核病预防控制科、消毒与感染控制科、病媒生物预防控制科、督办室。
主要分管人事科、传染病预防控制科、传染病预防控制二科、应急管理办公室、卫生监测科、职业卫生科、设备试剂管理科、总务科、科教信息科、放射卫生科。
主要分管性病艾滋病预防控制科、学校卫生科、非传染性疾病预防控制科、综合管理科、项目办、安全生产管理科、理化检验科、病毒病检验科、微生物与生物检验科。
主要分管纪监室、免疫规划科、质量控制科、财务科、内控审计科、地方病预防控制科。